Ce  jeu  Wii  U  haut  en  couleurs  va  débarquer  sur Nintendo  3DS.  Cette  version  contient  de  nouvelles  fonctionnalités,  ainsi  que  tous  les stages de la version originale. Les nouveaux stages exclusifs se focalisent sur Poochy, le compagnon  de  Yoshi  :  les  joueurs  vont  devoir  bien  calculer  les  sauts  de  Poochy  pour récolter les perles et les Tipoochy sur leur route. Les Tipoochy sont de curieuses petites créatures qui aideront les joueurs en sautant à certains endroits spécifiques afin de leur indiquer  où  se  trouvent  les  secrets  et  les  objets  collectionnables.  Nintendo  et  Dwarf,  le studio japonais d’animation en stop-motion,  collaborent  pour  la  création  de  30  courts animes dont Yoshi et Poochy seront les stars. Ces animes seront inclus dans la version Nintendo 3DS du jeu.

Une figurine amiibo de Poochy en laine sera également disponible  à la sortie du jeu le 3 février 2017. Un pack spécial incluant le jeu et un amiibo de Poochy sera également disponible à la même date.