Eminent spécialiste de la nanotechnologie, Heito Saimon refuse de céder sa science aux militaires. Pour le punir de cette trahison, ses associés suppriment sa femme et sa fille, l’amputent des deux bras et le laissent pour mort. Recueilli par un mystérieux professeur, Heito apprend à maîtriser une énergie psychique, le "Zethmos", lui permettant d’utiliser des prothèses, des bras de métal. Ivre de rage et avide de vengeance, Heito est devenu Hate, un puits de haine prêt à traquer ses bourreaux, où qu’ils se terrent.

L'affrontement entre Heito et Progress ne s'est pas passé comme prévu. Progress est non seulement capable de manipuler l'esprit des animaux, celui des humains, mais aussi celui du Zethmos d'Heito qui est devenu une entité à part entière. Pensant s'être débarassé de Heito, Progress a désormais le temps pour lancer sa fusée et donc d'imposer sa loi sur Terre. Rappelons que la fusée contient de l'eau infestée de nanomachines, chargées d'étouffer quiconque en boira. Bientôt remis sur pieds, Heito est bien décidé à en découdre pour de bon cette fois. Mais où trouver Progress ? En combattant l'empereur de la destruction, le fameux Swallow. A l'instar d'Heito, il sait manipuler le Zethmos et sa rage est beaucoup plus présente que celle d'Heito. Ce dernier apparaît ainsi fortement menacé, et pourtant, c'est en redevenant humain qu'il parviendra à prendre l'ascendant sur son adversaire du jour. Désormais équipé de nouveaux bras, quelle ne sera pas la surprise quand Heito découvrira que Progress a fusionné avec une forêt entière et qu'il a l'intention de faire de même avec sa femme. Heito ne semble pas faire le poids, et son ultime cible pourrait à nouveau lui échapper. Parviendra t-il à se reprendre et à déchainer toute l'étendue du Zethmos ?