The Civilization Blaster (Zetsuen no Tempest en japonais)  est un shonen assez étonnant. L'histoire débute lorsque la sorcière Hakaze est abandonné sur une île déserte par un mystérieux individu. Il est impossible de s'enfuir de cet endroit, surtout qu'une barrière magique entoure l'île, la rendant invisible aux yeux des bateaux. Le scénario nous dévoile alors les personnages de Yoshino et Mahiro, deux amis que le destin a séparé.  Cherchant des indices sur l'assassinat de sa soeur, Mahiro a soudainement disparu, et Yoshino n'a aucune idée où se trouve Mahiro à l'heure actuelle. Une femme le recherche pourtant, et n'hésite pas à mettre en joue Yoshino afin de connaître toute la vérité sur cette disparition. D'après elle, Mahiro est impliqué dans un conflit important, et le gouvernement japonais est à sa recherche. Apparemment, une sortie de magie est impliquée.

Profitant du puissant talisman donné par la princesse, Mahiro force Samon à chercher l'assassin de sa sœur dans les rangs du clan Kusaribe. Mais Yoshino s'interpose et tente de le raisonner. Commence alors un long jeu de dupes, et il est désormais l'heure pour que Hakaze, parvienne enfin à sortir de sa prison temporelle. Si elle veut empêcher la résurrection de l'arbre de la destruction, et réveiller l'arbre des origines, elle doit trouver une offrande nécessaire pour se téléporter. Comme un heureux hasard (ou non), voici qu'un missile de l'armée s'effondre juste à côté d'Hakaze. En route pour le mont Fuji, l'arrivée d'Hakaze va pour le moins redistribuer les cartes. A peine a-t-elle annoncée ses intentions que Yoshino et Mahiro sont violemment blessés. Les deux amis convalescents vont désormais évoluer chacun de leur côté, Mahiro avec Samon, toujours à la recherche de réponses, Yoshino avec Hakaze qui va peu à peu se rapprocher de lui ...