Kamisama Dolls est un manga seinen qui a connu douze tomes au Japon aux éditions Shogakukan, ainsi qu'une adaptation en animé. L'intrigue met est en scène le personnage de Kyôhei, qui a récemment quitté son village natal non seulement pour venir étudier en ville, mais aussi pour s'éloigner de troubles évènements. Alors qu'il est en soirée avec des amis, dont son ancienne voisine Shiba, après avoir consommé de l'alcool toute la nuit, lui et Shiba découvre le corps d'un homme sauvagement assassiné dans un ascenseur.  Un meurtre qui ne manque pas de les choquer ... ni même l'explication qui en découle : Sa jeune sœur Utao, accompagnée d'une poupée en bois (les fameuses Kakashi), lui apprend que son ami Aki et son Kakashi sont les responsable de cet horrible drame. En outre, un mystérieux personnage vêtu de noir les poursuit comme une ombre ...

Après une série d'évènements étrange, Kyôhei et Utao n'ont pas d'autres choix que de retourner à l'endroit d'origine des Kakashi, le village Kurakami. Hibino, un ami de leur père, a compris beaucoup de choses au sujet de cette légende. Voilà qui promet, surtout que les apparences sont une fois encore extrêmement trompeuses. De retour à Tokyo, le groupe va devoir face à Kôshirô Hyûga, bien décidé à rallier Aki à leur clan. Maintenant que tout le monde a conscience des pouvoirs des Kakashi, la prudence s'impose. Pendant ce temps, Shiba et Utao continuent la formation de cette dernière, qui va devoir affronter des adversaires de plus en plus dangereux. L'aspect seinen du manga commence à sérieusement se renforcer au fil des pages ...