Il y a quinze ans de cela, après un contact avec une mystérieuse substance chimique, quatre tortues se sont transformées en tortues géantes, tandis que leur propriétaire prenait pour sa part l'apparence d'un rat. Reclus depuis dans les canalisations new-yorkaises, Maître Splinter a formé Leonardo, Michaelangelo, Donatello et Raphaël, aux techniques des guerriers ninjas, afin d'affronter les rues dangereuses de Manhattan. Cependant, les Tortues Ninja n'ont encore jamais quitté leur repaire,  et déguster les merveilleuses pizzas si populaire à la saga. Apparu à la fin des années 1990, les Tortues Ninja profitent en effet de la sortie d'un nouveau film chez Paramount Pictures pour revenir sous la forme d'un reboot en bande dessinée.

Ici point point d'effets spéciaux gigantesques, les quatre tortues ainsi que tout le bestiaire d'ennemis habituel répondent présents, mais l'intrigue réserve quelques changements également, et prend plusieurs libertés sur la série originale. Après avoir subi un entraînement hors du commun, les Tortues Ninja vont croiser sur leur route une kyrielle de nouveaux ennemis.  C'est notamment le cas de Snake l'herbe, un personnage qui avant d'être touché par le mutagène, était l'un des chauffeurs des Krangs. C'est désormais une peste géante qui ambitionne de conquérir le monde. Rien que ça.