The Unit met en scène un contingent spécial de l'armée américaine chargé de missions délicates et ultra-secrètes. Dans la plus grande discrétion, ils opèrent à leurs risques et périls à travers le monde. Leurs épouses, contraintes au silence, ont pour devoir de donner l'apparence d'une vie de famille normale. Elles donnent le change au quotidien tout en tremblant à chaque seconde pour la sécurité de leur mari, parti risquer leur vie pour sauver celle des autres. Jonas Blane (Dennis Haysbert) est le chef de l'unité en charge des missions sur le terrain. L'unité est composée du Colonel Tom Ryan (Robert Patrick), Mack Gerhardt (Max Martini), Charles Grey (Michael > Irby), Hector Williams (Demore Barnes) et la nouvelle recrue, Bob Brown (Scott Foley). Ils sont tous très compétents, dignes de confiance et extrêmement courageux. Les membres de l'unité, où l'esprit d'équipe domine, doivent sans cesse compter les uns sur les autres pour espérer rester en vie durant leurs missions.

Mission 1 : L'Avenir du Monde
Le nouveau venu Bob Brown rejoint l'équipe de Jonas. Ils sont assignés à sauver un avion détourné avec à son bord des hommes d'affaires européens. Pendant ce temps, les épouses des membres de l’unité aident Kim, l’épouse de Bob, à s’acclimater aux nouvelles règles qui vont désormais régir sa vie personnelle…
Mission 2 : Une Vie à Deux
Alors qu’ils sont chargés de récupérer un satellite perdu en Afrique, un terroriste international devient la proie de l’unité. Jonas et son équipe, toutefois privée de Bob Brown, doivent s’adapter à cette nouvelle situation et poursuivre ce terroriste. De son côté, Kim Brown commence à réaliser ce qui l’attend lorsqu’elle doit consoler une femme dont le mari est mort en mission…
Mission 3 : Une Grande Famille
Jonas tente de sauver un groupe de missionnaires américains réfugiés aux Philippines, mais il va rencontrer un problème de taille : deux missionnaires refusent de le suivre. Pendant ce temps, Bob tire sur Mack par inadvertance lors d’une séance d’entraînement…
Mission 4 : Protection Rapprochée
Quand Alberto Salazar, le nouveau ministre mexicain en charge de la lutte anti-drogue, arrive à Los Angeles pour des discussions de la plus haute importance avec le D.E.A. L’unité suspecte alors un cartel mexicain de vouloir l’assassiner sur le sol américain. Leur mission de protection devient beaucoup plus complexe lorsque la famille du ministre se fait kidnapper…
Mission 5 : Opération "Feux de Prairie"
L’Unité est désavouée par le gouvernement espagnol et ses membres sont considérés comme personae non grata après avoir mené à bien un assassinat lors de leur dernière mission en Espagne. Jonas réussit à s’échapper facilement tandis que Bob tente de repartir avec difficultés puisqu’il se fait arrêter. Pendant ce temps, Jonas et Molly essaient de convaincre leur fille de ne pas arrêter ses études pour s’enrôler dans l’armée…
Mission 6 : Rivalités
L’Unité est envoyée en mission à l’ambassade de Russie en Israël avec pour objectif de trouver des preuves qui permettront d’établir que les russes sont sur le point de revendre aux Iraniens les éléments nécessaires à la construction d’une bombe nucléaire. Mais les choses s’annoncent difficiles dès le début quand Bob se fait refuser l’accès à l’ambassade et que Jonas semble ne pas parvenir à en déjouer la sécurité. Pendant ce temps, Kim devient suspicieuse après avoir vu Tiffy se faufiler dans une chambre d’hôtel et reporte l’incident pour des raisons de sécurité à l’amant secret de Tiffy ; le colonel Tom Ryan…
Mission 7  Le Sens de l'Honneur
Une mission jointe devant intercepter le convoi d’un leader Taliban en Afghanistan échoue lorsque l’Hélicoptère de l’équipe de Bravo se pose à cause d’un problème de moteur. Jonas doit alors faire face à un terrible dilemme ; quitter l’hélicoptère et continuer la mission, ou sauver les hommes de Bravo. Pendant ce temps, Molly organise une cérémonie à l’honneur de l’ancien membre de l’Unité Ron Cheals et découvre qu’il se bât contre une dépendance aux médicaments...
Mission 8 : S.E.R.E.
L’Unité met en place Sere (Survie, Evasion, Résistance, Echappe), un exercice d’entraînement éreintant recourrant à la torture et à l’humiliation qui se base sur les entraînements que les militaires utilisent pour se préparer à la capture par des forces ennemies. L’épreuve s’avère particulièrement difficile pour Bob, déjà malade au début de l’entraînement, et dont la dureté aggrave presque mortellement son cas. Pour compliquer les choses, la CIA organise des exercices qui n’ont virtuellement pas de limites au niveau des sévices corporelles et de la manipulation émotionnelle utilisés pour faire craquer les recrues. Si tel est le cas, elles sont renvoyées de l’Unité...
Mission 9 : Jeunesse Sacrifiée
Après qu’une tentative d’achat de missiles sol-air à un baron de la drogue échoue et que les missiles disparaissent, Jonas et son équipe doivent retrouver les armes avant qu’elles ne quittent le pays. Jonas négocie avec le dirigeant de l’équipe d’où les SAMs ont été pris puis envoyés par bateau. Maintenant l’Unité doit les détruire. Pendant ce temps, Kim rencontre des problèmes lorsqu’elle insiste pour que le « Family Readiness Group » aborde des sujets plus sérieux, tandis que William ne sait comment dire à la femme qu’il compte épouser qu’il est un membre de l’Unité et non un commis à la base...
Mission 10 : Dans la Gueule du Loup
Quand Bob perd sa couverture lors d’un entraînement de soldats en Afrique, il conseille à Jonas d’annuler la visite d’un haut dignitaire en raison d’un danger imminent. Cependant, tout devient plus compliqué quand ils apprennent que la visite est une couverture. En dépit des avertissements, l’officier de haut rang refuse d’annuler ses plans. Pendant ce temps, Kim reçoit une visite inattendue à son travail, à la station de radio, alors que Molly se voit l’opportunité d’un investissement immobilier.
Mission 11 : Délit de Fuite
Quand Keith Soto, le fils d’un ancien membre de l’Unité, revient à la base pour une réunion, Jonas et le colonel Tom Ryan découvrent qu’il est un journaliste travaillant sur un sujet qui menace le caractère strictement confidentiel de l’Unité. Bien que perturbé par le fait que Keith utilise la réunion pour développer son sujet, Jonas décide de lui dire la vérité sur la manière dont son père a été tué en mission à la condition qu’il ne publie pas l’article. Jonas est extrêmement tendu par le fait d’avoir a empêché Keith de faire l’article, et son comportement perturbe l’Unité. Pendant ce temps, avec l’aide de Tiffy et de Kim, Molly essaie de retrouver la femme qui a détourné 40,000$ du fond d’investissement des femmes.
Mission 12 : Engrenage
Une bombe a été installée dans une banque d’Atlanta et les membres de l’Unité sont appelés en renfort. Ils se rendent vite compte que celle-ci est peut être nucléaire. Pendant ce temps Kim et Bob prévoient de prendre des vacances, mais Kim réalise rapidement qu’elle se retrouve liée à la mission de Bob qui veut qu’elle l’aide...
Mission 13 : L'Adieu aux Armes
L’unité est parvenue à capturer un ancien général yougoslave poursuivi pour crimes de guerre. Mais ce dernier parvient à s’échapper et cherche maintenant à se venger de Jonas qui est responsable de sa capture. Pendant ce temps, à la base, Tiffy pense à se séparer de Mack, et Kim reçoit des nouvelles quelque peu perturbantes.

Au niveau des suppléments, le coffret comporte les commentaires audio du réalisateur, ainsi qu'un documentaire sur les Forces Spéciales Américaines.

(c) Fox/M6