Il y a très longtemps, une terrible guerre opposa la Déesse et le Dieu du mal. Comme ils étaient de force égale, ils créèrent tous deux de nombreuses armes spéciales, emplies de leur énergie magique et contenant chacune la force vitale d'une fée. Ainsi armées, les divinités continuèrent de s'affronter jusqu'à se sceller mutuellement dans le grand néant. Le temps a passé depuis ce conflit oublié, et les armes créées par la Déesse et le Dieu du mal ont été dispersées à travers le monde. Ces armes, les « Furies », sont très recherchés par des guerriers autoproclamés « Fencers ». On rapporte que quiconque collecte une Furie se voit accorder un voeu. Et lorsqu'un jeune homme du nom de Fang décida d'arracher une Furie prise dans la pierre, il devint par inadvertance un Fencer lui-même, altérant à jamais le cours de son destin.

Développé par COMPILE HEART, Fairy Fencer F est un RPG  en tour par tour. Les personnages ont été dessinés par Tsunako (série Hyperdimension Neptunia), les esquisses de conception sont l'oeuvre de Yoshitaka Amano, et la musique a été composée par Nobuo Uematsu, ces deux derniers étant particulièrement réputés pour leur travail sur la célèbre série Final Fantasy.