CI Games présente Sniper: Ghost Warrior 3, la plus complète des expériences de sniper disponibles à ce jour. Chaque personnage dispose de ses propres expériences et motivations, tant d'un point de vue professionnel que personnel. La façon dont les objectifs et la personnalité de chacun des protagonistes entrent en conflit ou se complètent permet d'offrir une expérience de jeu encore plus riche.

Jon North est largué en plein coeur d'une zone de conflit dans la République de Géorgie. Située au croisement de l'Europe de l'Est et de l'ouest de l'Asie, la Géorgie revêt une importance stratégique et elle est plongée dans le chaos de la guerre civile. La mission confiée à Jon consiste à neutraliser les leaders séparatistes qui déstabilisent le pays.
Ce dernier tente personnellement de se remettre de la capture et de la mort présumée de son jeune frère Robert, il y a de cela pratiquement deux ans. Jon était présent lors de l'attaque mais n'a rien pu faire pour sauver son frère. D'après les rapports du renseignement sur les écoutes, Robert serait pourtant bel et bien vivant, prisonnier en Géorgie dans une zone contrôlée par les séparatistes. Jon y voit donc une deuxième chance de sauver son frère.

Jon est un Marine et il n'a de cesse de mener à bien les missions qu'on lui confie. Frank Simms, depuis longtemps l'agent de liaison de Jon, soutient ce dernier dans sa recherche, tant qu'il accomplit les missions qui lui ont été officiellement confiées. Jon a choisi une équipe pour l'aider à accomplir tous ses objectifs. 

Le premier membre qu'il choisit pour son équipe est Lydia Jorjadze, mercenaire et ex-membre du SFB géorgien. Lydia est un vétéran qui a déjà courageusement combattu aux côtés de Jon en Afghanistan. Leur liaison passionnée a pris fin lorsque Jon a soudainement disparu, après un combat mortel. Lydia accepte d'aider Jon dans le but de découvrir ce qui s'est réellement passé en Afghanistan.  

Raquel Shein, un agent du MOSSAD, a également accepté de le soutenir, à la condition que Jon l'aide à retrouver Sergei Flostov. Flostov est un brillant scientifique qui mène des expériences interdites. Les Israéliens veulent le retrouver pour y mettre un terme.

Alors que l'équipe élimine les leaders séparatistes et qu'elle se rapproche de la résistance géorgienne, un mystérieux sniper, Amazi, leur met des bâtons dans les roues ou au contraire vient les aider. Jon combat un ensemble divers de criminels, de militaires et de terroristes, pour retrouver la trace de Robert. En fin de compte, les deux frères devront faire face à une terrible vérité : un seul d'entre eux pourra survivre.