Après un contact avec une mystérieuse substance chimique, quatre tortues vivant dans les canalisations new-yorkaises se transforment en tortues géantes. Formés par un vieux rat sage, Leonardo, Michaelangelo, Donatello et Raphaël, par ailleurs amateurs de pizzas, apprennent les techniques des guerriers ninjas afin d'affronter le terrible Shredder dont le but avoué est d'asservir le monde. Dans ce nouveau cycle, les conflits se multiplient : Alors que le Général Krang livre son nouveau plan diabolique, la vie de Casey Jones se délite au fil des jours poussant Raphael à intervenir. Pour ne rien arranger, quelque chose s'est échappé des laboratoires Stockgen, ce qui n'augure rien de bon pour les Tortues Ninja. Un prédateur semble être sur leurs traces !

Apparu à la fin des années 1990, les Tortues Ninja profitent de la sortie d'un nouveau dessin animé fin 2012 chez Nickelodeon pour revenir sous la forme d'un reboot en bande dessinée. Ici point point d'effets spéciaux gigantesques, les quatre tortues ainsi que tout le bestiaire d'ennemis habituel répondent présents, mais l'intrigue réserve quelques changements également, et prend plusieurs libertés sur la série originale. Le récit semble moins violent que l'original. Peut être une question de cible ?