Inazuma Eleven 3 arrive en exclusivité sur Nintendo 3DS dans deux versions différentes : Inazuma Eleven 3 : Foudre céleste et Inazuma Eleven 3 : Feu explosif, dès le 27 septembre 2013.  Pour ceux qui auraient choisi de se procurer l'édition digital, sachez que chaque jeu requiert 13.214 blocs libres, soit 1,6 Go d'espace libre sur la carte SD.