Mer d'Ecosse. Amy Silva (Suzanne Jones) enquête sur ce qu'elle croit être le meurtre d'un membre d'équipage sur le sous-marin Vigil et donc tout le monde devrait se plier à sa volonté. Sa demande initiale est que le bateau retourne au port afin qu'une autopsie puisse être effectuée et que les suspects soient interrogés sous caution en présence d'un avocat. Cependant, la dissuasion nucléaire du Royaume-Uni exige que l'un des quatre sous-marins Vanguard soit opérationnel en mer à tout moment, disponible pour livrer des ogives sur demande.  Le capitaine Neil Newsome de Vigil est sur la sellette et il considère la défense de la nation comme supérieure à l'enquête sur une mort suspecte. Les arguments des deux parties sont plausibles. Silva est transportée par hélicoptère jusqu'au sous-emplacement et treuillée jusqu'à la tourelle de commandement. Elle n'est pas autorisée à communiquer avec son quartier général et dispose de trois jours pour résoudre le mystère. Peu à peu, elle commence à découvrir ce qui s'est passé dans les jours qui ont précédé la mort du sous-officier Craig Burke. On voit d'abord le marin lorsqu'il conteste un ordre direct de ne pas essayer d'aider les pêcheurs dont le chalutier a été entraîné vers le bas, apparemment après que leur filet ait accroché le sous-marin. Burke reçoit l'ordre de quitter le pont et de se rendre à sa couchette, où il est retrouvé plus tard mort. L'héroïne se trouve dans ses narines et la marine décide qu'il s'agit d'une surdose, quoique légèrement inhabituelle.

D'autres conflits sont en cours sur terre, Kirsten Longrace (Rose Leslie), la partenaire détective de Silva ayant du mal à obtenir des réponses claires des pontes de la Royal Navy. Sur le bateau, Silva désigne initialement l'officier exécutif Mark Prentice comme responsable du crime après qu'il est admis avoir frappé Burke (qu'il considérait comme un traître à cause de sa relation avec une anti-nucléaire) et lui avoir mis de l'héroïne dans le nez post-mortem après avoir trouvé Burke mort au lit et supposé que c'était dû à un traumatisme crânien retardé. Pendant ce temps, le capitaine Newsome a découvert qu'un sous-marin ennemi les avait « suivis » et qu'il était responsable de la chute du chalutier. C'était mortel pour les trois pêcheurs mais aussi profondément préoccupant pour la défense du Royaume-Uni que Vigil n'était pas au courant de la présence de l'autre sous-marin. Alors que les problèmes de Newsome augmentent, le réacteur nucléaire qui alimente le sous-marin développe un problème et le marin Gary Walsh, qui se battait avec Burke sur terre, est blessé dans l'incident.Il y a beaucoup de choses à faire pour les téléspectateurs, mais comme c'est la mode dans les séries télévisées, il faut plus de complexité. Ainsi, nous obtenons la trame de fond de Silva. Elle prend des médicaments pour l'anxiété et la dépression et a des flashbacks, déclenchés par le sous-marin, de la mort de sa fiancé et du sauvetage de sa jeune fille après que leur voiture s'est écrasée dans la mer. Pendant ce temps, il semble y avoir eu une relation intime avec sa partenaire policière à un moment donné.