Selon Unseen64.net,  le développeur espagnol Mercury Steam  (Castlevania: Lords of Shadow 1 & 2) aurait présenté un prototype Metroid à Nintendo, sans que le studio ne soit sollicité par le constructeur japonais.

Il s'agissait d'un FPS prévu sur Wii U et 3DS, et prenant place dans un monde post-apocalyptique. Samus était le personnage principal, mais il était également possible d'incarner sept chasseurs de primes différents. Apparemment, Nintendo aurait rejeté le projet et le prototype aurait muté un FPS spatial comme le montre le teaser sur le site de MercurySteam.