La version Switch de New Super Mario Bros. U Deluxe tourne en 1080p natif (mode TV), tandis que la version Wii U n’atteint que 720p. Le mode portatif atteint 720p sans autre perte graphique. Le framerate est de 60 images par seconde quelque soit le mode. 

Il n'y a pas d'anti-aliasing, à la place un filtrage de texture amélioré a été trouvé, qui se rapproche du filtrage anisotrope 16x. Par ailleurs, la dissolution des ombres a été augmentée.  Enfin, à  l'exception de Peach, tous les modèles de personnages sont identiques à ceux de la Wii U.