1951, Alabama, États-Unis. Après la Seconde Guerre mondiale, les Russes mettent la main sur le scientifique nazi Manfred Fürbringer, qui s'était enfui en Égypte. Mais les connaissances de l'ingénieur pour suivre les Américains dans la course aux armements. Le MGB met donc en place un projet fou : laisser partir Fürbringer pour qu'il soit "recruté" par la CIA et qu'ils puissent l'utiliser comme taupe dans l'impénétrable Redstone Arsenal, où sont développés les premiers missiles balistiques américains.

Dans La Guerre Invisible, nous découvrons l'histoire de l'après-guerre entre l'Amérique et la Russie, qui luttent pour l'hégémonie dans le domaine de la technologie des missiles. Dans la première histoire, nous suivons deux membres de la CIA qui doivent retrouver un expert en missiles, Manfred Fürbringer, au Caire où il s'est réfugié après la guerre. Incapables de le retrouver, ils sollicitent l'aide d'un orphelin allemand. Rudi est censé être adopté par Max, le frère du père déchu de Rudi. Mais Max est en réalité un agent de la CIA. En mettant Rudi à l'école, ils espèrent retrouver le fils de Fürbringer, car si vous avez le fils, vous avez le père. Ils y parviennent, et il s'agit maintenant de convaincre Fürbringer de passer aux mains des Américains. Mais il ne se sent pas prêt à le faire. Il déteste les Américains autant que les Russes qui, d'une certaine manière, ont le pouvoir sur lui. Les agents de la CIA ne le savent pas et le lecteur non plus, comme le révèle l'histoire 2, qui commence à Berlin en 1945 lorsque l'officier Klymov est envoyé pour kidnapper le même Fürbringer et gagner à la cause russe. Cependant, Klymov perd Fürbringer et s'attire de sérieux ennuis. Il est accusé de malveillance, ce qui s'aggrave lorsque la mère de Klymov demande l'asile politique en Suède à l'occasion d'une exposition. Elle est peintre. Klymov doit alors tout mettre en œuvre pour sauver sa peau. Il jure solennellement de traquer Fürbringer, où qu'il se trouve. Le lecteur sait depuis la première partie où se trouve cet endroit et nous voyons même le protagoniste de la deuxième partie y passer brièvement.