Le producteur Hiroyuki Sakamoto et le réalisateur Ryosuke Horii du studio Ryu Ga Gotoku de Sega ont révélé de nouveaux détails sur « Yakuza Kiwami 3 & Dark Ties » lors d'une interview. Nous ne souhaitons évidemment pas vous les cacher. L'histoire se concentre sur Yoshitaka Mine, un antagoniste déjà connu de « Yakuza 3 », qui apparaît cette fois comme protagoniste jouable. « Dark Ties », quant à lui, est conçu comme un spin-off à part entière et se concentre sur le passé de Mine. Selon Horii, le personnage se distingue clairement du héros de la série, Kiryu, qui agit par sens de la justice et aide les autres. Mine, quant à lui, est un gangster, marqué par la solitude et le désarroi. Il n'aide que lorsqu'on le lui demande directement. Le titre est développé dans le but de mettre en avant le caractère complexe de Mine et ses motivations.

L'intrigue repose sur un récit introspectif centré sur les pensées et les conflits intérieurs de Mine. Si des personnages secondaires, comme Kanda, apparaissent, le facteur décisif reste la confrontation de Mine avec lui-même. Le cœur du sujet réside dans la question de savoir si les réponses qu'il cherche existent réellement au sein du milieu yakuza. Sakamoto souligne également que « Dark Ties » diffère des histoires précédentes de la série, qui mettent généralement en scène d'anciens yakuzas ayant aidé ou protégé des personnes. Le chemin de Mine, en revanche, est davantage une descente dans des ténèbres toujours plus profondes, ce qui confère à la série un ton nouveau.